W strukturach Zakładu znajdują się pracownie: histopatologiczna, cytologiczna, immunohistochemiczna oraz genetyki nowotworów. Rocznie wykonujemy około 60 000 badań histopatologicznych, 7 000 badań cytologicznych, około 7 000  badań immunohistochemicznych, około 500 badań molekularnych (w tym badania DNA HPV i badania CISH) oraz 1500 biopsji cienkoigłowych. Nasz Zakład może się pochwalić unikalnym doświadczeniem jeśli chodzi o badania śródoperacyjne, których wykonujemy średnio 1500 rocznie. Jesteśmy pod tym względem niekwestionowanym liderem.

W ostatnich latach udało się wyposażyć Zakład w jedną z najnowocześniejszych linii aparaturowych służących do przygotowywania preparatów histopatologicznych spełniającą wymogi europejskie. W ubiegłym roku w ramach programu Cyfrowa Polska wzbogaciliśmy się o najnowszy a zarazem największy produkowany skaner 3 D Histech P1000 służący do digitalizacji naszego archiwum szkiełkowego.

Nasz Zakład świadczy usługi również dla podmiotów zewnętrznych w tym ościennych szpitali i poradni. Od ponad 10 lat aktywnie uczestniczymy w realizacji Programu Profilaktyki Raka Szyjki Macicy.

Zakład Patomorfologii Klinicznej naukowo specjalizuje się w badaniach molekularnego podłoża nowotworów narządów rodnych i piersi a także endometriozy. Nasze wyniki publikujemy corocznie w około 10 czasopismach, głównie międzynarodowych.